MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri I5007 plasmid pLRI05

Total Repeats: 282

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021497	ACA	2	6	4	9	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512595025
2	NC_021497	TAT	2	6	12	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595025
3	NC_021497	A	7	7	35	41	100 %	0 %	0 %	0 %	512595025
4	NC_021497	TTA	2	6	160	165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595025
5	NC_021497	A	6	6	165	170	100 %	0 %	0 %	0 %	512595025
6	NC_021497	GGC	2	6	175	180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512595025
7	NC_021497	GAT	2	6	214	219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512595025
8	NC_021497	GCG	2	6	220	225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512595025
9	NC_021497	TTTA	2	8	260	267	25 %	75 %	0 %	0 %	512595025
10	NC_021497	GGC	2	6	283	288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512595025
11	NC_021497	GCC	2	6	320	325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512595025
12	NC_021497	GAA	2	6	375	380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512595025
13	NC_021497	A	6	6	379	384	100 %	0 %	0 %	0 %	512595025
14	NC_021497	TGC	2	6	429	434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512595025
15	NC_021497	TGA	2	6	465	470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512595025
16	NC_021497	AAG	2	6	515	520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512595025
17	NC_021497	TGC	2	6	551	556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512595025
18	NC_021497	TG	3	6	590	595	0 %	50 %	50 %	0 %	512595025
19	NC_021497	ATC	2	6	607	612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595025
20	NC_021497	CAC	2	6	684	689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512595025
21	NC_021497	AAGC	2	8	715	722	50 %	0 %	25 %	25 %	512595025
22	NC_021497	CAT	2	6	801	806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595025
23	NC_021497	GCC	2	6	817	822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512595025
24	NC_021497	CGC	2	6	848	853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512595025
25	NC_021497	TTA	2	6	879	884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595025
26	NC_021497	CAAA	2	8	952	959	75 %	0 %	0 %	25 %	512595026
27	NC_021497	ATG	2	6	998	1003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512595026
28	NC_021497	GTG	2	6	1011	1016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512595026
29	NC_021497	AGC	2	6	1030	1035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512595026
30	NC_021497	TGC	2	6	1077	1082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512595026
31	NC_021497	GGC	2	6	1096	1101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512595026
32	NC_021497	GTC	2	6	1166	1171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512595026
33	NC_021497	ATT	2	6	1178	1183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595026
34	NC_021497	TGA	2	6	1209	1214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512595026
35	NC_021497	AAG	2	6	1233	1238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512595026
36	NC_021497	CCG	2	6	1296	1301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512595026
37	NC_021497	GGT	2	6	1376	1381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512595026
38	NC_021497	AC	3	6	1479	1484	50 %	0 %	0 %	50 %	512595026
39	NC_021497	TTGG	2	8	1584	1591	0 %	50 %	50 %	0 %	512595026
40	NC_021497	AAC	2	6	1619	1624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512595026
41	NC_021497	CCA	2	6	1677	1682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512595026
42	NC_021497	ATT	2	6	1715	1720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595026
43	NC_021497	GGCT	2	8	1751	1758	0 %	25 %	50 %	25 %	512595026
44	NC_021497	ATT	2	6	1798	1803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595026
45	NC_021497	GGT	2	6	1809	1814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512595026
46	NC_021497	GTG	2	6	1826	1831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512595026
47	NC_021497	GGC	2	6	1835	1840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512595026
48	NC_021497	CGG	2	6	1858	1863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512595026
49	NC_021497	TCG	2	6	1980	1985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512595026
50	NC_021497	CTG	2	6	1998	2003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512595026
51	NC_021497	TCAT	2	8	2058	2065	25 %	50 %	0 %	25 %	512595026
52	NC_021497	CTA	2	6	2101	2106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595026
53	NC_021497	CTG	2	6	2117	2122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512595026
54	NC_021497	CTG	2	6	2142	2147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512595026
55	NC_021497	GCT	2	6	2149	2154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512595026
56	NC_021497	TTC	2	6	2162	2167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595026
57	NC_021497	GTT	2	6	2453	2458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512595026
58	NC_021497	TAT	2	6	2469	2474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595026
59	NC_021497	TGT	2	6	2526	2531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512595027
60	NC_021497	TCA	2	6	2597	2602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595027
61	NC_021497	CCAA	2	8	2624	2631	50 %	0 %	0 %	50 %	512595027
62	NC_021497	ATT	2	6	2660	2665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595027
63	NC_021497	ATC	2	6	2711	2716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595027
64	NC_021497	TGGCT	2	10	2760	2769	0 %	40 %	40 %	20 %	512595027
65	NC_021497	ATG	2	6	2773	2778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512595027
66	NC_021497	TGA	2	6	2837	2842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512595027
67	NC_021497	ACA	2	6	2886	2891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512595027
68	NC_021497	GCA	2	6	2895	2900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512595027
69	NC_021497	AAC	2	6	2904	2909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512595027
70	NC_021497	TCG	2	6	2964	2969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512595027
71	NC_021497	CAA	2	6	3022	3027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512595027
72	NC_021497	CGG	2	6	3029	3034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512595027
73	NC_021497	CAC	2	6	3036	3041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512595027
74	NC_021497	ATTG	2	8	3117	3124	25 %	50 %	25 %	0 %	512595027
75	NC_021497	A	6	6	3173	3178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021497	A	6	6	3257	3262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021497	T	7	7	3324	3330	0 %	100 %	0 %	0 %	512595028
78	NC_021497	A	6	6	3334	3339	100 %	0 %	0 %	0 %	512595028
79	NC_021497	T	6	6	3523	3528	0 %	100 %	0 %	0 %	512595028
80	NC_021497	AT	3	6	3666	3671	50 %	50 %	0 %	0 %	512595028
81	NC_021497	CGC	2	6	3679	3684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512595028
82	NC_021497	GAA	2	6	3685	3690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512595028
83	NC_021497	ACT	2	6	3693	3698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595028
84	NC_021497	T	6	6	3722	3727	0 %	100 %	0 %	0 %	512595028
85	NC_021497	AAT	2	6	3854	3859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512595028
86	NC_021497	GATA	2	8	3883	3890	50 %	25 %	25 %	0 %	512595028
87	NC_021497	CAA	2	6	3976	3981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512595028
88	NC_021497	TGG	2	6	4020	4025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512595028
89	NC_021497	CGA	2	6	4146	4151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512595028
90	NC_021497	TGATT	2	10	4222	4231	20 %	60 %	20 %	0 %	512595028
91	NC_021497	AGT	2	6	4289	4294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512595028
92	NC_021497	GTT	2	6	4318	4323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512595028
93	NC_021497	TCT	2	6	4343	4348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595028
94	NC_021497	TTA	2	6	4395	4400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595028
95	NC_021497	AAGA	2	8	4441	4448	75 %	0 %	25 %	0 %	512595028
96	NC_021497	TTA	2	6	4456	4461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512595028
97	NC_021497	TA	3	6	4466	4471	50 %	50 %	0 %	0 %	512595028
98	NC_021497	GTT	2	6	4487	4492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512595028
99	NC_021497	CTT	2	6	4501	4506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595028
100	NC_021497	AAT	2	6	4514	4519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512595028
101	NC_021497	CTT	2	6	4586	4591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_021497	ATTG	2	8	4610	4617	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021497	T	6	6	4645	4650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021497	A	7	7	4655	4661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021497	T	7	7	4704	4710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021497	TTAT	2	8	4719	4726	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021497	C	6	6	4778	4783	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
108	NC_021497	GATA	2	8	4878	4885	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021497	AT	3	6	4886	4891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021497	TATT	2	8	4912	4919	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021497	TG	3	6	4954	4959	0 %	50 %	50 %	0 %	512595029
112	NC_021497	GGC	2	6	5031	5036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512595029
113	NC_021497	T	6	6	5050	5055	0 %	100 %	0 %	0 %	512595029
114	NC_021497	GTAG	2	8	5096	5103	25 %	25 %	50 %	0 %	512595029
115	NC_021497	ATC	2	6	5125	5130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595029
116	NC_021497	ATA	2	6	5369	5374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021497	AG	3	6	5389	5394	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021497	T	6	6	5422	5427	0 %	100 %	0 %	0 %	512595030
119	NC_021497	TTC	2	6	5484	5489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595030
120	NC_021497	CTT	2	6	5571	5576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595030
121	NC_021497	CTT	2	6	5579	5584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595030
122	NC_021497	TTG	2	6	5616	5621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512595030
123	NC_021497	AAG	2	6	5644	5649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512595030
124	NC_021497	TCA	2	6	5695	5700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595030
125	NC_021497	GAGAG	2	10	5725	5734	40 %	0 %	60 %	0 %	512595030
126	NC_021497	TTG	2	6	5782	5787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512595030
127	NC_021497	ATC	2	6	5988	5993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595030
128	NC_021497	AT	3	6	6094	6099	50 %	50 %	0 %	0 %	512595030
129	NC_021497	AAC	2	6	6114	6119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512595030
130	NC_021497	ATC	2	6	6141	6146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595030
131	NC_021497	CAT	2	6	6177	6182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595030
132	NC_021497	ACCTTA	2	12	6199	6210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595030
133	NC_021497	TAG	2	6	6275	6280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512595030
134	NC_021497	TCA	2	6	6416	6421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595030
135	NC_021497	ATC	2	6	6422	6427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595031
136	NC_021497	TAA	2	6	6460	6465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512595031
137	NC_021497	TTC	2	6	6503	6508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595031
138	NC_021497	TTG	2	6	6528	6533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512595031
139	NC_021497	TTC	2	6	6554	6559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512595031
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141	NC_021497	CT	3	6	6683	6688	0 %	50 %	0 %	50 %	512595031
142	NC_021497	AT	3	6	6788	6793	50 %	50 %	0 %	0 %	512595031
143	NC_021497	TTG	2	6	6846	6851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512595031
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257	NC_021497	TTG	2	6	13021	13026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512595036
258	NC_021497	CAT	2	6	13070	13075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512595036
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261	NC_021497	GTT	2	6	13296	13301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512595036
262	NC_021497	TGC	2	6	13305	13310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512595036
263	NC_021497	TTAT	2	8	13332	13339	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_021497	TA	3	6	13361	13366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_021497	GTA	2	6	13406	13411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
266	NC_021497	TCG	2	6	13480	13485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_021497	T	9	9	13515	13523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_021497	C	6	6	13536	13541	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
269	NC_021497	C	6	6	13558	13563	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
270	NC_021497	T	7	7	13585	13591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_021497	GGATA	2	10	13599	13608	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
272	NC_021497	GGATA	2	10	13643	13652	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
273	NC_021497	C	6	6	13671	13676	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
274	NC_021497	T	7	7	13677	13683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_021497	ATG	2	6	13725	13730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
276	NC_021497	T	6	6	13786	13791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_021497	GTCC	2	8	13819	13826	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
278	NC_021497	A	7	7	13923	13929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_021497	TGAC	2	8	13931	13938	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
280	NC_021497	AAT	2	6	13944	13949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_021497	GTCA	2	8	13960	13967	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
282	NC_021497	AGG	2	6	14036	14041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.